Les temps sont troubles, les jours passent sans se ressembler. Le monde shinobi est rongé par le fléau que représente Akatsuki, une organisation bâtie par des renégats et dirigée par le puissant Madara Uchiwa.
Nous sommes pendant la réunion des 5 Kages, où Madara est intervenu pour leur proposer de lui rendre les réceptacles de Hachibi et Kyubi. La réponse fût unanime : Non. Après cette intervention forcée, la réunion continua, malgré la fuite de Danzô. Les mots étaient lancés en l'air, aucun accord ne fût conclu, même "L'alliance Shinobi" qui avait pour but d'allier tous les villages cachés pour écraser Akatsuki et le projet "Oeil de Lune", déclaré par Madara.
Depuis ce temps, les villages préparent leur défense, leur frontière, et tous les ninjas capables de se battre au nom de leur raison de vivre. Sans aucuns accords, les villages cachés se débrouillent seuls.
Avec leur seul force non-unifiée, la guerre promet d'être longue et sanglante..
C'est à vous d'écrire l'histoire.